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我国3000份绿色超级稻基因组原始测序数据从“云端”向全球共享

日期:2015年9月21日 20:19

  9月15日,中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司在长沙共同启动“云之稻项目”,3000份绿色超级稻基因组原始测序数据,将正式通过阿里云平台,向全球免费开放。这不仅有利于加快规?;⒕蛩居帕蓟?,突破水稻复杂性状分子改良的技术瓶颈,还能加快高产、优质、广适性新品种培育的进程,全面提升我国及全球水稻基因组研究和分子育种水平。
  来源于全球89个国家的3000份水稻核心种质基因组测序数据,是科技部和比尔·梅琳达盖茨基金会“为非洲和亚洲资源贫瘠地区培育绿色超级稻”重大科技专项的重要课题成果,这也是迄今为止全世界最大的植物基因组测序项目。项目旨在培育能够广泛适用于灌溉和雨养地区生态环境,并具氮磷高效利用、抗病、抗虫、高产、优质、抗逆(干旱、盐碱)等特性的水稻新品种,在目标国示范推广,推动杂交稻种子生产能力,并为撒哈拉以南非洲国家、亚洲和中国的西南地区水稻分子育种建立一个高效水稻基因型分析技术平台。
  为水稻核心种质做基因组测序,是一项庞大工程。该基因数据库资源,至少有两方面用途,一是从基因库调取数据,研究目标基因的分布、进化和功能。二是可分析基因组之间的多态性位点,并以之开发分子标记,甚至是基因芯片,用于分子育种。通过对3000份水稻核心种质基因组测序分析,能够回答水稻有多少遗传多样性可以应用,从哪里获取生物育种所需遗传资源的问题,分析得到的数据将为水稻基础认识和生物育种提供基础信息资源。这项研究可揭示全球栽培稻资源的基因组多样性,和每个水稻资源的遗传特点及应用价值。此外,将3000份水稻种质资源带入水稻育种应用中,将为水稻育种创新提供材料和新思路,对数据的分析结果还将填补人们对水稻甚至各个物种在基因组学方面的知识空缺。
  据专家介绍,当水稻基因组研究碰上“云计算”将会产生极大的魔力。比如说,刚退出的“两优0293”品种的不足之处就是稻瘟病的抗性比较差,而3000分水稻基因组研究将借助于“云之稻”项目,在3年内,将不仅能找到更多的抗病基因,而且有望让新品种稻瘟病的抗性提高到3级以上,从而培育产量、抗性等相对全面的水稻新品种,促使超级稻品种的适应性更好、更广。

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